从1992年开始，实验室与联合国教科文组织下属的世界遗产保护中心就意识到这座已经有1400年历史的伟大建筑已经不堪重负，整个地基已经沉降，廊柱与拱檐裂纹丛生，大理石塑像布满污垢，但最令人焦虑的是布满教堂拱顶，共计1900平方米的玻璃镶嵌画—这些拜占廷艺术遗产的精华，已经处于毁灭边缘。自1934年土耳其共和国创立者凯末尔慷慨地把它作为博物馆向全世界开放以来，大批进入的游客显著地增加教堂内部的空气湿度与温度，加速了石膏墙面的剥蚀与镶嵌画表面的氧化。